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San Lorenzo de Almagro se inscribió a la Federación Metropolitana en 1950, siendo reafiliado en 1973. En ese lapso de tiempo obtuvo el subcampeonato en la Copa Interclubes que organizó la propia entidad en 1949.
A fines del Siglo XXI, ganó la Copa Morgan 1984 y 1985, cumpliendo además destacadas actuaciones en Cuarta y Quinta División mientras que su máximo logró fue acceder a la División de Honor en 1996.
Lo mejor de la actividad llegó a partir de 2004, cuando vuelve a conseguir la Copa Morgan y el Campeonato de Segunda División en forma invicta. También fue campeón de Primera en el 2008 y subió a División de Honor, logrando lo mismo pero a través de los playoff en el 2010. En esta década, también hubo varios títulos en los niveles formativos, que llegaron a escalar hasta el Nivel A, el máximo en el ámbito metropolitano.
Camila Jersonsky -en 2007- fue la única jugadora de San Lorenzo que participó de la Selección Argentina.